Основными функциями Центра лицензионно-разрешительной работы являются: организация и проведение на территории Томской области работы по государственному контролю за оборотом служебного, гражданского оружия, частной охранной и детективной деятельностью, выдача лицензий и разрешений:

• на торговлю гражданским и служебным оружием и патронами к нему юридическим лицам;
• на коллекционирование, экспонирование оружия и патронов юридическим лицам и гражданам Российской Федерации;
• на приобретение гражданского и служебного оружия и патронов к нему на территории Российской Федерации юридическим лицам с особыми уставными задачами, организациям, занимающимся испытанием изделий на пулестойкость, юридическим лицам, осуществляющим коллекционирование оружия и патронов, спортивным организациям и образовательным учреждениям;
• на приобретение охотничьего огнестрельного оружия с нарезным стволом гражданам Российской Федерации;
• на осуществление негосударственной (частной) охранной и негосударственной (частной) сыскной деятельности и осуществление контрольных функций, отнесённых законодательством к компетенции подразделений лицензионно-разрешительной работы, а также разрешений:
• на ввоз в Российскую Федерацию и вывоз из Российской Федерации оружия и патронов, принадлежащих гражданам, для использования оружия на спортивных соревнованиях и в целях охоты;
• на хранение и ношение охотничьего огнестрельного оружия с нарезным стволом гражданам Российской Федерации;
• на хранение и ношение наградного оружия, а также оружия, выдаваемого в соответствии со статьёй 19 Федерального закона от 13 декабря 1996 года № 150 «Об оружии»;
• на хранение оружия юридическим лицам и гражданам по месту проведения выставок, выставок-продаж и аукционов;
• на хранение и использование оружия организациям, занимающимся испытанием изделий на пулестойкость, образовательным учреждениям, спортивным и охотничьим организациям, в структуре которых имеются тиры, стрелково-стендовые комплексы и стрельбища, а также на хранение оружия и патронов, передаваемых им членами спортивных стрелковых обществ и клубов для ответственного хранения на указанных объектах;
• на использование оружия (в тире, стрелково-стендовом комплексе, на стрельбище);
• на хранение оружия и патронов юридическим лицам-перевозчикам, имеющим транспортные лицензии на данный вид деятельности;
• на перевозку оружия и патронов юридическим лицам, занимающимся автомобильными и другими видами перевозок, а также таможенным перевозчикам;
• на хранение оружия и (или) патронов юридическим лицам или гражданам Российской Федерации;
•  на ношение и использование охотничьего оружия  гражданам Российской Федерации;
• на передачу иностранному гражданину охотничьего оружия для ношения и использования в целях охоты юридическим лицам или индивидуальным предпринимателям.